不少地区的广大农民群众在播种时，都有用化肥作种肥的习惯。但不是所有的化肥都可以作种肥，有的化肥不宜作保种肥，有的则要讲究施用方法。
一是对种子有腐蚀作用的肥料不宜作种肥。如碳酸氢铵具有腐蚀性和挥发性，对磷酸钙含有游离态的硫酸和碳酸，两者对种子都有强烈的腐蚀作用，因此不宜作种肥。如必须用做种肥，应避免与种子接触，可将碳酸氢铵施在播种沟（穴）之下，与种子相隔一定土层，或将过磷酸钙与土杂肥料混合之后再施用。
二是含有氯离子的化肥不宜用做种肥。氯化钾、氯化铵等化肥含有氯离子，施入土壤后产生水溶性氯化物，对种子发芽和幼苗生长不利。硝酸钾等肥料中含有硝酸根离子，也不宜用做保种肥。